| 執筆者一覧 |
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| 山下一郎 | 松下電器産業(株) 先端技術研究所 主幹研究員
奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 メゾスコピック物質科学講座 客員教授
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 芝清隆 | (財)癌研究会癌研究所 蛋白創製研究部 部長
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 河村秀樹 | (財)癌研究会癌研究所 蛋白創製研究部 嘱託研究員
(株)村田製作所 次世代技術研究所 主任 |
| 三浦篤志 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 博士研究員 |
| 金丸周司 | 東京工業大学 大学院生命理工学研究科 生物プロセス専攻 助教 |
| 鈴木治和 | (独)理化学研究所 ゲノム科学総合研究センター(GSC) 遺伝子構造・機能研究グループ プロジェクト副ディレクター |
| 臼井健悟 | (独)科学技術振興機構 CREST 研究員
(独)理化学研究所 ゲノム科学総合研究センター(GSC) 遺伝子構造・機能研究グループ 訪問研究員 |
| 林崎良英 | (独)理化学研究所 ゲノム科学総合研究センター(GSC) 遺伝子構造・機能研究グループ プロジェクトディレクター |
| 岩堀健治 | (独)科学技術振興機構 CREST 研究員 |
| 安部聡 | 名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 博士課程 |
| 上野隆史 | 名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 助教
(独)科学技術振興機構 PRESTO 研究員 |
| 小林未明 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科
(独)科学技術振興機構 CREST 博士研究員 |
| 塚本里加子 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科
(独)科学技術振興機構 CREST 技術員 |
| 杉本健二 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科
(独)科学技術振興機構 CREST 博士研究員 |
| 柏木健司 | (財)癌研究会癌研究所 蛋白創製研究部
(独)科学技術振興機構 CREST 研究員 |
| 佐野健一 | (財)癌研究会癌研究所 蛋白創製研究部
(独)科学技術振興機構 CREST 研究員 |
| 梅津光央 | 東北大学 大学院工学研究科 准教授 |
| 芹澤武 | 東京大学 先端科学技術研究センター 准教授
(独)科学技術振興機構 さきがけ |
| 松野寿生 | 東京大学 駒場オープンラボラトリー 助教 |
| 松浦和則 | 九州大学大学院 工学研究院 応用化学部門 准教授
(独)科学技術振興機構 PRESTO |
| 髙谷光 | 大阪大学 大学院基礎工学研究科 助教
(現 京都大学 化学研究所 元素科学国際研究センター 准教授)
(独)科学技術振興機構 PRESTO 研究員 |
| 磯崎勝弘 | 大阪大学 大学院基礎工学研究科
(独)物質・材料研究機構 ナノ有機センター |
| 芳賀祐輔 | 大阪大学 大学院基礎工学研究科 |
| 上杉隆 | 大阪大学 大学院基礎工学研究科 |
| 中谷昭彦 | 大阪大学 大学院基礎工学研究科 |
| 直田健 | 大阪大学 大学院基礎工学研究科 |
| 村田智 | 東京工業大学 大学院総合理工学研究科 准教授 |
| 齊藤博英 | 京都大学大学院 生命科学研究科 遺伝子動態分野 助教
(独)科学技術振興機構 ICORP グループリーダー |
| 井上丹 | 京都大学大学院 生命科学研究科 遺伝子動態分野 教授
(独)科学技術振興機構 ICORP 研究総括 |
| 佐々木善浩 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 助教
(現 東京医科歯科大学 生体材料工学研究所 准教授) |
| 田文杰 | 大連民族学院 生命科学学院 生物工程系 副教授 |
| 菊池純一 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 教授 |
| 浦岡行治 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 准教授 |
| 桐村浩哉 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 博士研究員 |
| 冬木隆 | 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科 教授 |
| 熊谷慎也 | 松下電器産業(株) 先端技術研究所 |
| 吉井重雄 | 松下電器産業(株) 先端技術研究所 主任研究員 |
| 寒川誠二 | 東北大学 流体科学研究所 教授 |
| 鈴木直毅 | 大阪大学 産業科学研究所 博士研究員
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 安立京一 | 大阪大学 産業科学研究所 博士研究員
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 李奉局 | 大阪大学 産業科学研究所 博士研究員
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 川合知二 | 大阪大学 産業科学研究所 教授(所長)
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 一木隆範 | 東京大学 大学院工学系研究科 バイオエンジニアリング専攻 准教授
東京大学 ナノバイオ・インテグレーション研究拠点 |
マニッシュ・
ビヤニ | 東京大学 大学院工学系研究科 バイオエンジニアリング専攻 リサーチフェロー |
| 根本直人 | ジェナシス(株) 最高科学責任者
埼玉大学 大学院理工学研究科 物質科学部門 物質機能領域 准教授(2008年4月1日より) |
| 松尾保孝 | 北海道大学 電子科学研究所 分子認識素子研究分野 助教 |
| 居城邦治 | 北海道大学 電子科学研究所 分子認識素子研究分野 教授 |
| 田畑仁 | 東京大学 大学院工学系研究科 バイオエンジニアリング専攻 教授 |
| 松井宏 | ニューヨーク市立大学 ハンター校 化学科 Professor |
| 松村幸子 | (財)癌研究会癌研究所 蛋白創製研究部
(独)科学技術振興機構 SORST 研究員 |
| 湯田坂雅子 | NEC基礎・環境研究所 主任研究員
(独)科学技術振興機構 SORST |
| 飯島澄男 | 名城大学 理工学部 教授
NEC基礎・環境研究所
(独)科学技術振興機構 SORST |
| 南野徹 | 大阪大学 大学院生命機能研究科 助教
(独)科学技術振興機構 ICORP 超分子ナノマシンプロジェクト |
| 難波啓一 | 大阪大学 大学院生命機能研究科 教授
(独)科学技術振興機構 ICORP 超分子ナノマシンプロジェクト |
| 北野宏明 | 特定非営利活動法人システム・バイオロジー研究機構 会長
(株)ソニーコンピュータサイエンス研究所 取締役副所長 |
| 木賀大介 | 東京工業大学 大学院総合理工学研究科 准教授 |
| 上田昌宏 | 大阪大学 大学院生命機能研究科 特任教授
(独)科学技術振興機構 CREST |
| 高木拓明 | 大阪大学 大学院生命機能研究科
奈良県立医科大学 医学部 助教 |
| 新井由之 | 大阪大学 大学院生命機能研究科 特任助教 |
| 冨樫祐一 | 大阪大学 大学院生命機能研究科 特任助教 |
| 柳田敏雄 | 大阪大学 大学院生命機能研究科 教授 |
| 構成および内容 |
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| 【第I編 バイオナノプロセスとナノテクノロジー】 |
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| 第1章 | バイオナノプロセスとは（山下一郎、芝清隆） |
| 1 | ナノテクノロジー時代 |
| 2 | バイオナノプロセス |
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| 第2章 | バイオナノプロセスをめぐる世界の動き（河村秀樹、三浦篤志、芝清隆、山下一郎） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 機能性材料合成のためのバイオナノプロセス |
| 2.1 | 天然のタンパク質、微生物を人為的環境下に置く方法 |
| 2.2 | 人工分子、人工ペプチドを用いる方法 |
| 2.3 | バイオミネラルの形状を活かした利用 |
| 2.4 | 今後のバイオナノプロセスによる機能性材料合成 |
| 3 | デバイスファブリケーションのためのバイオナノプロセス |
| 3.1 | GroELを用いたフラッシュメモリ作製 |
| 3.2 | 植物ウイルスを用いたメモリデバイス開発 |
| 3.3 | バクテリアウイルスを用いたリチウム電池開発 |
| 3.4 | フェリチンを用いた研究 |
| 4 | おわりに |
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| 【第II編 バイオナノプロセスを支える要素技術】 |
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| 第3章 | イントロ：自己組織化ナノブロックとしての生体高分子（山下一郎、芝清隆） |
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| 第4章 | 蛋白質に見いだすナノブロック構造（金丸周司） |
| 1 | はじめに |
| 2 | ウイルスキャプシド蛋白質 |
| 3 | 筒状蛋白質・リング状蛋白質 |
| 3.1 | タバコモザイクウィルス |
| 3.2 | 繊維状ファージ |
| 3.3 | ファージテイル |
| 4 | ポリペプチド鎖が繰り返し配列を持つ蛋白質 |
| 4.1 | 1本鎖βヘリックス |
| 4.2 | 3本鎖βヘリックス |
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| 第5章 | ナノレゴプロジェクト（鈴木治和、臼井健悟、林崎良英） |
| 1 | 「ナノレゴ」の基本概念 |
| 2 | ナノレゴの基礎実験 |
| 2.1 | ナノレゴ素子拡充の試み |
| 2.2 | 接着素子の解析 |
| 2.3 | ナノレゴ設計のための基礎実験 |
| 2.4 | 生体超分子における安定複合体形成のメカニズム解明 |
| 3 | ナノレゴの新規概念 |
| 4 | ナノレゴによる線状構造体の形成 |
| 5 | ロック付接着素子を用いたナノレゴ線状構造体 |
| 6 | ナノレゴ研究の今後 |
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| 第6章 | 球殻状ナノブロックとしてのフェリチン分子を用いたナノ粒子作製（岩堀健治、山下一郎） |
| 1 | はじめに |
| 2 | タンパク質超分子とバイオテンプレート |
| 2.1 | バイオの世界とタンパク質超分子 |
| 2.2 | バイオテンプレート法によるナノ粒子作製の歴史 |
| 3 | アポフェリチンタンパク質を用いたナノ粒子作製 |
| 3.1 | フェリチンタンパク質 |
| 3.2 | フェリチンタンパク質の自己組織化能とバイオミネラリゼーション能 |
| 3.3 | アポフェリチンタンパク質による酸化物ナノ粒子の作製 |
| 3.4 | アポフェリチンタンパク質による化合物半導体ナノ粒子の作製 |
| 4 | リステリア細菌由来Dpsタンパク質を用いたナノ粒子作製 |
| 5 | バイオミネラリゼーションのメカニズム |
| 6 | まとめ |
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| 第7章 | ナノ構造蛋白質の内部空間利用（安部聡、上野隆史） |
| 1 | はじめに |
| 2 | ナノ構造蛋白質 |
| 3 | ナノ構造蛋白質内部での金属微粒子の合成 |
| 4 | ナノ構造蛋白質の内部空間利用 |
| 4.1 | 医療材料への応用 |
| 4.2 | 触媒反応への利用 |
| 5 | まとめ |
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| 第8章 | 筒状ナノブロックとしてのTMVとテトラポッド型超分子構造体（小林未明、塚本里加子、杉本健二、山下一郎） |
| 1 | TMVを用いたナノワイヤの合成 |
| 2 | テトラポッド型超分子構造体 |
| 3 | 基板上へのナノワイヤ、テトラポッド型超分子構造体の選択的配置、配列化と電子デバイスへの応用 |
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| 第9章 | 人工ペプチド・タンパク質進化実験（柏木健司、芝清隆） |
| 1 | ナノテクノロジーと人工タンパク質 |
| 2 | 進化分子工学 |
| 3 | ファージ提示法 |
| 4 | 細胞表層提示法 |
| 5 | in vitro提示法 |
| 6 | ライブラリ作製 |
| 7 | ライブラリの多様性とブロックシャッフリング |
| 8 | 人工タンパク質創出系MolCraft |
| 9 | おわりに |
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| 第10章 | 無機材料を標的にしたペプチド・アプタマーの異種界面形成（佐野健一、芝清隆） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 無機材料を標的にしたペプチド・アプタマー |
| 3 | ペプチド・アプタマーと無機材料の異種界面形成 |
| 4 | TBP-1とチタン表面の異種界面形成 |
| 5 | 無機材料結合ペプチドに偏在するアミノ酸種 |
| 6 | ペプチド・アプタマーの多機能性 |
| 7 | ペプチド・アプタマーのナノテクノロジー領域への応用 |
| 8 | おわりに |
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| 第11章 | セラミックス結合・合成ペプチド（梅津光央） |
| 1 | ミネラル成分を鉱物化する生体分子 |
| 2 | 生体内からの同定・抽出 |
| 3 | 分子進行工学的技法を用いた非天然ペプチドの創出 |
| 4 | 酸化亜鉛結合性ペプチドの選択と応用 |
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| 第12章 | ナノバインダーとしての高分子結合性ペプチド（芹澤武、松野寿生） |
| 1 | はじめに |
| 2 | ポリメタクリル酸メチル（PMMA）結合性ペプチドの探索 |
| 3 | 合成ペプチドによる結合実験 |
| 4 | 必須ペプチドモチーフの決定 |
| 5 | その他の高分子ターゲット |
| 6 | おわりに |
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| 第13章 | ペプチドの自己集合によるナノ構造の構築（松浦和則） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 両親媒性ペプチド |
| 3 | βシート形成ペプチド |
| 4 | コイルドコイル形成ペプチド |
| 5 | オリゴペプチド |
| 6 | 三回対称性ペプチドコンジュゲート |
| 7 | おわりに |
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| 第14章 | メタル化ペプチドを用いる金属の精密集積制御～組成・配列・空間配置制御と機能開拓～
（髙谷光、磯崎勝弘、芳賀祐輔、上杉隆、中谷昭彦、直田健） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 錯体化学的手法による金属集積化 |
| 3 | メタル化アミノ酸およびメタル化ペプチドの開発 |
| 4 | メタル化ペプチドの超音波ゲル化と金属集積制御 |
| 5 | 異種金属集積型ペプチドの開発と機能開拓 |
| 6 | まとめ |
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| 第15章 | DNAタイルのセルフアセンブリ（村田智） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 材料としてのDNA分子 |
| 3 | 粘着末端と枝分かれ構造 |
| 4 | DNAタイル |
| 5 | アルゴリズミックなセルフアセンブリ |
| 6 | まとめと展望 |
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| 第16章 | ナノブロックとしてのRNA分子（齊藤博英、井上丹） |
| 1 | はじめに |
| 2 | RNAの構造 |
| 3 | ナノブロックとしてのRNA |
| 4 | ナノブロックRNAの応用分野 |
| 4.1 | Synthetic biologyにおけるRNA |
| 4.2 | NanotechnologyにおけるRNA |
| 5 | RNA/RNPの分子デザインと試験管内進化 |
| 5.1 | 人工RNAのデザインと創成 |
| 5.2 | 人工RNPのデザインと創成 |
| 6 | RNA/RNPブロックを利用した分子デザインの展望 |
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| 第17章 | 脂質膜の自己組織化能を利用する分子デバイス作製（佐々木善浩、田文杰、菊池純一） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 脂質膜基板の作製と分子素子の組織化 |
| 3 | 脂質膜型分子デバイスの機能 |
| 4 | おわりに |
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| 【第III編 バイオナノプロセスによるデバイス作成】 |
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| 第18章 | イントロ：トゥルーナノテクノロジーとしてのバイオナノプロセス（山下一郎、芝清隆） |
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| 第19章 | バイオナノプロセスで作るフローティングゲートメモリ（三浦篤志、山下一郎） |
| 1 | はじめに |
| 2 | ナノドットを利用した不揮発性フラッシュメモリ |
| 3 | バイオナノドットフローティングゲート型メモリの作製と電気特性評価 |
| 4 | おわりに |
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| 第20章 | フェリチンタンパクを利用したシリコン薄膜の結晶化法（浦岡行治、桐村浩哉、冬木隆、山下一郎） |
| 1 | はじめに |
| 2 | フェリチンタンパクを用いた結晶化法 |
| 2.1 | フェリチンタンパクとは |
| 2.2 | フェリチンタンパク質の吸着密度制御 |
| 2.3 | 熱処理によるSi多結晶膜の固相成長 |
| 3 | 形成されたSi多結晶膜の結晶性 |
| 3.1 | XRDによる評価結果 |
| 3.2 | 後方散乱電子回析（EBSD）法による結晶粒径の評価結果 |
| 4 | パルスアニールによる短時間作製 |
| 5 | まとめ |
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| 第21章 | ナノ粒子の静電配置（熊谷慎也、吉井重雄、山下一郎） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 静電相互作用を利用した選択配置 |
| 3 | 吸着挙動の解析 |
| 3.1 | 解析の流れ |
| 3.2 | 相互作用ポテンシャル分布 |
| 3.3 | 相互作用ポテンシャル分布における各構成項の働き |
| 4 | 単一フェリチン分子選択配置 |
| 5 | おわりに |
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| 第22章 | ナノエッチング技術（寒川誠二） |
| 1 | 序論 |
| 2 | プラズマエッチングプロセスの課題 |
| 3 | 無損傷・量子構造の形成 |
| 4 | 量子ナノディスク構造による量子効果発現 |
| 5 | まとめ |
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| 第23章 | プログラム自己組織化によるナノ材料・デバイスの創製（鈴木直毅、安立京一、李奉局、川合知二） |
| 1 | はじめに |
| 2 | シーケンシャル自己組織化 |
| 2.1 | 自己組織化配線法 |
| 2.2 | DNAを用いたナノ分子デバイス |
| 3 | 生体分子の自己組織化的ナノアレイ化 |
| 4 | トップダウン/ボトムアップ融合による遷移金属酸化物薄膜の大面積ナノ加工 |
| 4.1 | 機能性遷移金属酸化物を用いた赤外線センサ |
| 4.2 | NIL-モリブデン・リフトオフ法 |
| 5 | おわりに |
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| 第24章 | 酵素分子の高速人工進化のためのナノバイオセンシング（一木隆範、マニッシュ・ビヤニ、根本直人） |
| 1 | はじめに |
| 2 | セルアレイ型分子進化リアクターの原理・構成 |
| 3 | ビーズを担体として用いるラベル化タンパク質分子のアレイ化配置技術 |
| 4 | 「DNA-Proteinチップ」法によるラベル化タンパク質分子のアレイ化配置技術 |
| 5 | 蛍光アッセイによる酵素活性スクリーニングシステム |
| 6 | おわりに |
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| 第25章 | BioLBL法によるin aquaでの高次ナノ構造形成（佐野健一、芝清隆） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 交互積層法Layer-By-Layer |
| 3 | BioLBL法～Biomimetic Layer-By-Layer Assembly |
| 4 | DP-BioLBL |
| 5 | 将来展望 |
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| 第26章 | DNA-金属デバイス（松尾保孝、居城邦治） |
| 1 | ボトムアップ型ナノテクノロジーとDNA |
| 2 | 電子回路作製のための材料として見たDNAの特徴・利点 |
| 3 | 自己組織化によるナノ配線 |
| 4 | 単一DNA分子の自己組織化的伸長固定化 |
| 5 | DNAの金属化による導電性ナノ配線の作製 |
| 6 | まとめ |
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| 第27章 | DNAネットワークによるナノパターニング（田畑仁） |
| 1 | 概要 |
| 2 | DNAエレクトロニクス |
| 3 | DNA自己組織化利用ナノパターン形成―ボトムアップナノテクノロジー― |
| 3.1 | DNA分子を鋳型としたナノ構造制御（プログラム自己組織化パターニング） |
| 3.2 | ナノ構造形成メカニズム |
| 3.3 | プリンタブルエレクトロニクス |
| 4 | DNAナノテクノロジー |
| 4.1 | DNA分子の電子状態 |
| 4.2 | DNAネットワークの機能化：蛍光分子ドープによる光スイッチ |
| 5 | まとめ |
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| 第28章 | ペプチドナノリアクター～ペプチドナノリアクターを用いた生物擬態的な室温での物質合成とそのナノリアクターの基板上における選択的配置～（松井宏） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 環状ペプチドをナノリアクターとして用いた正方晶系BaTiO3ナノ粒子の室温合成 |
| 3 | 環状ペプチドをナノリアクターとして用いたβ-Ga2O3半導体ナノ粒子の室温合成 |
| 4 | 基板上における環状ペプチドの特定の位置への自己集合的アッセンブリー法 |
| 5 | おわりに |
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| 第29章 | カーボンナノチューブでつくるメディカル・デバイス（松村幸子、湯田坂雅子、飯島澄男、芝清隆） |
| 1 | はじめに |
| 2 | カーボンナノチューブの特性と水との相性 |
| 3 | カーボンナノチューブの水中分散化 |
| 4 | ドラッグ・デリバリー・システム（DDS）とは |
| 5 | キャリアの大きさとEPR効果 |
| 6 | いろいろな物質のキャリアとして用いられるカーボンナノチューブ |
| 7 | カーボンナノホーンをDDSキャリアとして使う |
| 8 | カーボンナノチューブを用いたバイオセンサ |
| 9 | おわりに |
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| 【第IV編 これからのバイオナノプロセス】 |
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| 第30章 | イントロ：生物に学ぶ高次自己組織化（芝清隆、山下一郎） |
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| 第31章 | 自己組織化体としての生体超分子（南野徹、難波啓一） |
| 1 | はじめに |
| 2 | べん毛の構築制御 |
| 3 | べん毛蛋白質輸送装置 |
| 4 | べん毛蛋白質輸送の分子機構 |
| 5 | べん毛繊維の自己構築 |
| 6 | 繊維やフックの長さを決める仕組み |
| 7 | おわりに |
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| 第32章 | 生物学的ネットワークと自己組織化（北野宏明） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 生物学的ネットワークの大域構造 |
| 3 | 進化可能で、ロバストなシステムのアーキテクチュア |
| 4 | モジュールのロバストネス |
| 5 | アーキテクチュア |
| 6 | ロバストネスと脆弱性のトレードオフ |
| 7 | 自己拡張共生ネットワーク |
| 8 | おわりに |
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| 第33章 | 合成生物学とバイオナノプロセス（木賀大介） |
| 1 | はじめに |
| 2 | 生物の階層性および、AnalysisとSynthesis |
| 3 | 生体高分子を組み合わせる |
| 4 | 細胞内に遺伝子を組み合わせるためには制御関係の作り込みが必要となる |
| 5 | 試験管内で生体高分子を組み合わせる |
| 6 | 今後のバイオナノプロセスと合成生物学 |
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| 第34章 | 細胞における確率的情報処理の解明に向けて（上田昌宏、高木拓明、新井由之） |
| 1 | はじめに |
| 2 | コンピュータと生物情報処理システムの動作状況における根本的差異 |
| 3 | 情報分子の構造多型性 |
| 4 | 細胞における情報分子の反応速度論的多状態性 |
| 5 | 細胞内情報処理システムにおけるノイズ生成・処理・伝搬の理論 |
| 6 | おわりに |
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| 第35章 | 生物に学ぶナノデバイスの設計思想～ゆらぎの排除から利用へ～（冨樫祐一、柳田敏雄） |
| 1 | 従来のナノデバイス―ゆらぎを排除する思想 |
| 2 | ケーススタディ―ゆらぎの下で働く分子モーター |
| 3 | 1分子実験―分子モーターの動作原理に迫る |
| 4 | ゆらぎを利用するための構造 |
| 5 | 集積化―ゆらぎを利用するシステムへ |
| 6 | おわりに |
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